杜氏盐藻光系统Ⅱ反应中心蛋白D2 基因的克隆及序列分析

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摘要根据莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)、Oryza sativa、Chlorella vulgaris以及Mesostigma viride 等真核生物的psbD基因的氨基酸高度保守序列,设计一对简并引物,利用TRIzol试剂提取杜氏盐藻(Dunaliella salina)细胞的总RNA,通过RT-PCR,得到杜氏盐藻cDNA片段的长度大约为1 000bp.该序列的PCR产物经T-A克隆并测序分析以及测序结果推导成氨基酸序列,Blast同源性分析表明所克隆的基因为杜氏盐藻psbD基因,编码杜氏盐藻光系统Ⅱ反应中心D2蛋白,该序列已递交GenBank(GenBank登录号为:DQ074450).编码的氨基酸序列,同源性依次为:Chlamydomonas reinhardtii 92%,Nephroselmis olivacea 88%,Pinus thunbergii 88%,Amborella trichopoda 88%,Chlorella vulgaris 88%.通过密码子偏爱性分析表明,psbD基因存在明显的密码子偏爱性,其(A T)含量明显高于(G C)含量.

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收稿日期: 2007-03-25

引用本文:

刘红涛,宋建伟,臧卫东,鲁照明,王鹏举,薛乐勋. 杜氏盐藻光系统Ⅱ反应中心蛋白D2 基因的克隆及序列分析[J]. , 2007, 46(3): 0-0.
刘红涛,宋建伟,臧卫东,鲁照明,王鹏举,薛乐勋. Cloning and analysis of cDNA of photosystem Ⅱ reactor center protein D2 of Dunaliella salina. , 2007, 46(3): 0-0.

链接本文:

http://journal.ccnu.edu.cn/zk/CN/ 或 http://journal.ccnu.edu.cn/zk/CN/Y2007/V46/I3/0